6 апреля 2006 г. состоялся XI съезд профсоюза, рассмотревший вопросы:
1. Отчет о работе центрального комитета Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности за период с апреля 2001г. по март 2006 г.
2. Отчет Ревизионной комиссии Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности.
3. О внесении изменений и дополнений в Устав Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности.
4. Выборы председателя Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности.
5. О выборах заместителей председателя Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности.
6. Образование центрального комитета Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности.
7. Выборы Ревизионной комиссии Всероссийского профсоюза работников оборонной промышленности.
8. О выборах делегатов съезда ФНПР.